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首都兒科研究所屬于公立非營利性醫療機構，是集兒科基礎研究臨床高等教育預防保健為一體的兒科醫學機構是北京協和醫學院聯合申報兒科學博士碩士學位授權點國務院學位辦批準的臨床醫學一級學科碩士學位授權點北京大學。