首都兒科研究所的前身是中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院兒科研究所首都兒科研究所實(shí)力辦事，成立于1958年首都兒科研究所實(shí)力辦事，是新中國(guó)第一家以醫(yī)學(xué)基礎(chǔ)研究?jī)嚎萍膊“l(fā)病機(jī)理研究?jī)和＝橹攸c(diǎn)首都兒科研究所實(shí)力辦事，承擔(dān)有醫(yī)療教學(xué)和預(yù)防任務(wù)的應(yīng)用醫(yī)學(xué)研究機(jī)構(gòu)研究所于1983年劃歸北京市首都兒科研究所實(shí)力辦事，隸屬北京市。

首都兒科研究所是新中國(guó)第一家兒科研究所，也是唯一的國(guó)家級(jí)兒科研究所首都兒科研究所的首任所長(zhǎng)是被稱為中國(guó)兒科奠基人的諸福棠院士，也是兒科學(xué)界的第一位院士首都兒科研究所的首任副所長(zhǎng)是被稱為中國(guó)兒童保健事業(yè)創(chuàng)始。

首都兒科研究所原中國(guó)醫(yī)學(xué)科學(xué)院兒科研究所呼吸研究室科創(chuàng)建于1958年，1960年成立呼吸病房，1975年發(fā)展呼吸專業(yè)并建立呼吸功能室，并開展急性呼吸衰竭的呼吸器治療，1980年成立哮喘專業(yè)門診，1984年開展反復(fù)呼吸道感染。